Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms