Protein–RNA interactions for Protein: Q96SE7

ZNF347, Zinc finger protein 347, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF347Q96SE7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF347Q96SE7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms