Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms