Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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