Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms