Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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TM4SF18Q96CE8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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TM4SF18Q96CE8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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TM4SF18Q96CE8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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TM4SF18Q96CE8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TM4SF18Q96CE8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TM4SF18Q96CE8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TM4SF18Q96CE8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TM4SF18Q96CE8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TM4SF18Q96CE8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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