Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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