Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SS18Q15532 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SS18Q15532 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SS18Q15532 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SS18Q15532 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SS18Q15532 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SS18Q15532 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SS18Q15532 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SS18Q15532 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SS18Q15532 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SS18Q15532 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SS18Q15532 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SS18Q15532 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SS18Q15532 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SS18Q15532 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SS18Q15532 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SS18Q15532 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SS18Q15532 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SS18Q15532 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SS18Q15532 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms