Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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