Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms