Protein–RNA interactions for Protein: P04844

RPN2, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN2P04844 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPN2P04844 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPN2P04844 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPN2P04844 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPN2P04844 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPN2P04844 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPN2P04844 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPN2P04844 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPN2P04844 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPN2P04844 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPN2P04844 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPN2P04844 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPN2P04844 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPN2P04844 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPN2P04844 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPN2P04844 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPN2P04844 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPN2P04844 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN2P04844 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN2P04844 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPN2P04844 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPN2P04844 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPN2P04844 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPN2P04844 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPN2P04844 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPN2P04844 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPN2P04844 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPN2P04844 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPN2P04844 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPN2P04844 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPN2P04844 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPN2P04844 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RPN2P04844 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPN2P04844 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms