Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN6

SLC6A16, Orphan sodium- and chloride-dependent neurotransmitter transporter NTT5, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A16Q9GZN6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A16Q9GZN6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms