Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms