Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms