Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms