Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms