Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC1P35052 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC1P35052 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC1P35052 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC1P35052 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC1P35052 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC1P35052 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC1P35052 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC1P35052 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC1P35052 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC1P35052 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC1P35052 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC1P35052 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC1P35052 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC1P35052 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC1P35052 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms