Protein–RNA interactions for Protein: P16871

IL7R, Interleukin-7 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL7RP16871 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IL7RP16871 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IL7RP16871 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IL7RP16871 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IL7RP16871 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IL7RP16871 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IL7RP16871 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IL7RP16871 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IL7RP16871 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IL7RP16871 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IL7RP16871 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IL7RP16871 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IL7RP16871 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IL7RP16871 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IL7RP16871 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IL7RP16871 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IL7RP16871 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL7RP16871 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL7RP16871 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL7RP16871 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL7RP16871 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL7RP16871 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL7RP16871 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL7RP16871 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL7RP16871 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL7RP16871 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL7RP16871 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL7RP16871 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL7RP16871 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL7RP16871 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL7RP16871 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL7RP16871 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL7RP16871 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL7RP16871 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
IL7RP16871 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL7RP16871 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
IL7RP16871 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL7RP16871 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL7RP16871 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL7RP16871 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL7RP16871 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL7RP16871 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL7RP16871 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL7RP16871 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL7RP16871 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms