Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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