Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP3Q9BZ76 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms