Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCT8L2Q96SF2 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms