Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDH18Q13634 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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