Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCGB2A2Q13296 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCGB2A2Q13296 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCGB2A2Q13296 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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SCGB2A2Q13296 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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SCGB2A2Q13296 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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SCGB2A2Q13296 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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SCGB2A2Q13296 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCGB2A2Q13296 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCGB2A2Q13296 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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SCGB2A2Q13296 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCGB2A2Q13296 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCGB2A2Q13296 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCGB2A2Q13296 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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SCGB2A2Q13296 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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SCGB2A2Q13296 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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SCGB2A2Q13296 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCGB2A2Q13296 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCGB2A2Q13296 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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SCGB2A2Q13296 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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SCGB2A2Q13296 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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SCGB2A2Q13296 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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SCGB2A2Q13296 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCGB2A2Q13296 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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SCGB2A2Q13296 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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