Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD247P20963 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD247P20963 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD247P20963 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD247P20963 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD247P20963 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD247P20963 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD247P20963 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD247P20963 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD247P20963 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD247P20963 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD247P20963 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD247P20963 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD247P20963 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD247P20963 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD247P20963 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD247P20963 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD247P20963 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD247P20963 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD247P20963 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms