Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms