Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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SAMD8Q96LT4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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SAMD8Q96LT4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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SAMD8Q96LT4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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SAMD8Q96LT4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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SAMD8Q96LT4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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SAMD8Q96LT4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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SAMD8Q96LT4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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SAMD8Q96LT4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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SAMD8Q96LT4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SAMD8Q96LT4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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