Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF4BQ92750 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms