Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms