Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI6

C15orf39, Uncharacterized protein C15orf39, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf39Q6ZRI6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf39Q6ZRI6 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms