Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms