Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms