Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LTBQ06643 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms