Protein–RNA interactions for Protein: P00739

HPR, Haptoglobin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPRP00739 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPRP00739 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPRP00739 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPRP00739 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPRP00739 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPRP00739 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPRP00739 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPRP00739 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPRP00739 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPRP00739 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPRP00739 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPRP00739 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPRP00739 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPRP00739 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPRP00739 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms