Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD6O43541 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms