Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms