Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PIPSLA2A3N6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PIPSLA2A3N6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIPSLA2A3N6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIPSLA2A3N6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIPSLA2A3N6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms