Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms