Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms