Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.211e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 TUSC3-207ENST00000508446 457 ntTSL 35.79□□□□□ -1.481e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 NONO-202ENST00000373841 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.31e-42■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 NONO-215ENST00000535149 2882 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.61e-42■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 NONO-201ENST00000276079 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.631e-42■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 NONO-214ENST00000490044 3215 ntTSL 28.11□□□□□ -1.111e-42■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.623e-10■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 EEF1D-206ENST00000524397 957 ntTSL 320.83■□□□□ 0.933e-10■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 PIGT-248ENST00000639783 1691 ntTSL 219.54■□□□□ 0.723e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 IRAK1-210ENST00000455690 784 ntTSL 323■■□□□ 1.277e-12■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 IRAK1-213ENST00000477274 705 ntTSL 515.29■□□□□ 0.047e-12■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 DDB1-224ENST00000545894 2282 ntTSL 212.42□□□□□ -0.424e-15■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.883e-11■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.623e-11■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.613e-11■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.563e-11■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.453e-11■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 FAM49B-220ENST00000522250 1647 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.143e-11■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 FAM49B-215ENST00000519824 3798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.173e-11■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.113e-11■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.613e-11■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 FAM49B-225ENST00000523288 4552 ntTSL 24.39□□□□□ -1.713e-11■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 RALY-209ENST00000489384 227 ntTSL 37.69□□□□□ -1.186e-7■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.126e-8■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.056e-8■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 HAX1-210ENST00000531435 1284 ntTSL 211.97□□□□□ -0.496e-8■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.456e-8■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.454e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 04e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 MINDY1-203ENST00000361936 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.284e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 ARMT1-204ENST00000545879 2495 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.321e-9■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 ARMT1-201ENST00000367294 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.581e-9■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 DDI2-202ENST00000480945 10625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.83e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.973e-8■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.83e-8■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.763e-8■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.633e-8■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.393e-8■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.233e-8■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 EEF1D-219ENST00000527741 3718 ntTSL 211.81□□□□□ -0.526e-11■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.023e-14■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 HECTD3-205ENST00000486132 2385 ntTSL 1 (best)13.36□□□□□ -0.273e-14■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 HECTD3-201ENST00000372168 2530 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.383e-14■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 OGDH-201ENST00000222673 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.63e-6■■□□□ 12.8
PABPC4Q13310 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.662e-10■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.452e-10■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.312e-10■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.142e-10■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 ATRAID-204ENST00000472515 561 ntTSL 25.03□□□□□ -1.62e-10■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 EIF2S3-201ENST00000253039 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.082e-34■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 GUK1-221ENST00000472939 314 ntTSL 316.15■□□□□ 0.187e-9■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.922e-15■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.012e-15■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.313e-9■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 KPNA6-201ENST00000373625 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.013e-9■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 SLC25A6-202ENST00000475167 900 ntTSL 219.07■□□□□ 0.643e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 SLC25A6-203ENST00000484026 854 ntTSL 515.78■□□□□ 0.123e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 TPD52L2-208ENST00000474176 4053 ntTSL 211.5□□□□□ -0.579e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 GUK1-228ENST00000485168 737 ntTSL 320.17■□□□□ 0.826e-8■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 GUK1-223ENST00000478725 414 ntTSL 316.54■□□□□ 0.246e-8■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.422e-6■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.22e-6■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 PHB-215ENST00000617874 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.092e-6■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 PHB-214ENST00000614445 1952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.122e-6■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 IMPDH2-206ENST00000466147 691 ntTSL 221.26■□□□□ 0.992e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 IMPDH2-207ENST00000472328 469 ntTSL 321.26■□□□□ 0.992e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.045e-14■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 RPL38-206ENST00000533498 532 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.115e-14■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 RPL38-201ENST00000311111 1170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.485e-14■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.685e-14■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 H2AFZ-203ENST00000511319 1254 ntTSL 1 (best)35.07■■■■□ 3.21e-9■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 H2AFZ-202ENST00000511203 1880 ntTSL 233.71■■■□□ 2.991e-9■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.851e-9■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 H2AFZ-204ENST00000511348 1843 ntTSL 1 (best)15.01□□□□□ -0.011e-9■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 VARS-221ENST00000463184 619 ntTSL 224.34■■□□□ 1.498e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.241e-6■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 BAG6-237ENST00000375976 3644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.311e-6■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 BAG6-235ENST00000362049 3626 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.311e-6■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 BAG6-234ENST00000211379 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.441e-6■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 BAG6-236ENST00000375964 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.481e-6■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.068e-9■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.88e-9■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.062e-6■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 ERAL1-203ENST00000461894 1628 ntTSL 1 (best)14.19□□□□□ -0.142e-6■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 ERAL1-208ENST00000583487 695 ntTSL 313.26□□□□□ -0.292e-6■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 ERAL1-204ENST00000471992 1508 ntTSL 510.11□□□□□ -0.792e-6■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 PNN-206ENST00000557680 912 ntTSL 36.1□□□□□ -1.432e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.093e-11■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.573e-11■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.283e-11■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.163e-11■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 MTHFS-203ENST00000560261 595 ntTSL 310.64□□□□□ -0.713e-11■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.13e-11■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.383e-11■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.744e-9■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.694e-9■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 NDUFB8-208ENST00000531189 577 ntTSL 223.49■■□□□ 1.351e-9■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.134e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.14e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.024e-7■■□□□ 12.7
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