Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms