Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms