Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms