Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBASH3AP57075 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms