Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRATP43155 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRATP43155 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRATP43155 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRATP43155 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRATP43155 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRATP43155 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRATP43155 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRATP43155 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRATP43155 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRATP43155 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRATP43155 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRATP43155 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRATP43155 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRATP43155 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRATP43155 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRATP43155 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRATP43155 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRATP43155 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRATP43155 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRATP43155 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRATP43155 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRATP43155 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRATP43155 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRATP43155 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CRATP43155 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRATP43155 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRATP43155 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRATP43155 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRATP43155 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRATP43155 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRATP43155 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRATP43155 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRATP43155 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRATP43155 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRATP43155 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRATP43155 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRATP43155 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRATP43155 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CRATP43155 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRATP43155 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRATP43155 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRATP43155 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CRATP43155 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms