Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNCP24821 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TNCP24821 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TNCP24821 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
TNCP24821 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TNCP24821 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms