Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB3O43889 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB3O43889 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB3O43889 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB3O43889 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB3O43889 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB3O43889 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB3O43889 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB3O43889 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB3O43889 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB3O43889 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB3O43889 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB3O43889 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB3O43889 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB3O43889 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB3O43889 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB3O43889 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB3O43889 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB3O43889 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB3O43889 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB3O43889 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB3O43889 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB3O43889 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB3O43889 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB3O43889 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB3O43889 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB3O43889 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CREB3O43889 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CREB3O43889 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CREB3O43889 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms