Protein–RNA interactions for Protein: A6NHY6

C9orf118, Putative uncharacterized protein C9orf118, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf118A6NHY6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf118A6NHY6 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms