Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms