Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A12Q504Y0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms