Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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